Científicos: El "humano genéticamente perfecto" es una mujer puertorriqueña

Científicos: El "humano genéticamente perfecto" es una puertorriqueño

Publicado por RT  

En términos genéticos el ser humano ideal sería un puertorriqueño, según un nuevo estudio realizado por un biólogo de la Universidad de Berkeley, informa Wordpress.com. La razón es que puertorriqueños son una mezcla de herencia española, africana y taína.

Basándose en un análisis matemático, el investigador Lior Pachter sostiene que el "humano perfecto" aunaría los genes sanos de los diferentes grupos raciales

El articulo traducido por google:

El humano perfecto es puertorriqueño

Recientes noticias de la subasta de su medalla del Premio Nobel James Watson ha desenterrado un recuerdo muy desagradable para mí.

En marzo de 2004 asistí a una invitación única genómica reunión en el famosocentro de Banbury  en el Cold Spring Harbor Laboratory. Había oído historias legendarias sobre Banbury, y tengo que admitir que sentí honrado y emocionado cuando recibí la invitación. Había rumores de que él mismo a veces James Watson sería asistir a las reuniones. Los correos electrónicos que he recibido explicando laspolíticas secretas de Centro sólo añaden al encanto. Yo sentí que había recibido una invitación para la genómica equivalente de  Skull and Bones .

Aunque Watson no terminó de asistir a la reunión, se cumplieron mis expectativas cuando se decidió a caer en la cena una noche en  casa de Robertson . Sin previo aviso, se sentó a mi mesa. Yo estaba asombrado. La mesa era redonda con capacidad para seis personas, y Honesto Jim se sentó justo enfrente de mí.Hablaba sin cesar a lo largo de la cena y nos escuchó. Tristemente sin embargo, la mayor parte del tiempo que estuvo vomitando odio racista y misógino. Recuerdo que le pregunté retóricamente "¿quién querría adoptar un niño irlandés?" (Seguido de una diatriba contra los irlandeses que yo vi más tarde  repetí en las noticias ) y él hizo un punto para desprestigiar a Rosalind Franklin refiriéndose a ella despectivamente como "esa mujer ". Nadie en la mesa (me incluyo) dijo una palabra. Lamento profundamente que.

Una de las obsesiones de Watson ha sido la de  "mejorar" lo "humano imperfecto"a través de la ingeniería de la línea germinal humana. Esto es preocupante en muchos muchos niveles. En primer lugar, está el hecho de que durante años Watson presidida Cold Spring Harbor Laboratory que en realidad tiene una historia como un centro para la eugenesia . Luego están los numerosos comentarios despectivos de Watson sobre todo el que no es exactamente como él, dejando pocas dudas acerca de que él se imagina el "hombre perfecto" para ser. Pero dejando a un lado los sentimientos espeluznantes ... podría estar en lo cierto? ¿Es el "hombre perfecto" un americano de Chicago de mixto escocesa / ascendencia irlandesa? ¿Hay que esperar un mundo lleno de Watsons? He llevado a cabo recientemente un experimento mental a lo largo de estas líneas que describo a continuación. El resultado del experimento se dedica a James Watson, con motivo de su no cumpleaños hoy.

Introducción 

SNPedia  es una base de datos abierta de 59.593 SNPs y sus asociaciones. Una entrada SNP incluye campos para " magnitud "(una medida subjetiva de importancia en una escala de 0 a 10) y" honorabilidad "clasificaciones (buenas o malas), y alelos para muchas enfermedades y condiciones médicas. Por ejemplo, la entrada para un SNP (rs1799971) que se asocia con los antojos de alcohol  se describen los alelos "malos" "normales" y. Además de la asociación con fenotipos, SNPs también se puede asociar con las poblaciones. Por ejemplo, como se ve en laGeografía de variantes genéticas Browser , las frecuencias de alelos rs1799971 varían mucho entre los africanos, europeos y asiáticos. Si el genotipo de un individuo es conocido en muchos SNPs, por lo que es posible adivinar de dónde vienen: en el caso de alguien que es rs1799971 A: A es mucho más probable que sea africana de japonés, y con muchos SNPs la probabilidades pueden reducir la ubicación de un individuo a una ubicación geográfica muy específica. Este es el principio detrás de la aplicación del análisis de componentes principales  (PCA) para el estudio de poblaciones. Juntos, SNPedia y PCA, por tanto, proporcionan un camino para determinar donde un "hombre perfecto" podría ser de:

1. Crear un "hombre perfecto"  in silico mediante el establecimiento de los alelos en todos los SNPs de manera que sean "buenas".
2. Añadir el "hombre perfecto" a un grupo de individuos con genotipo de toda una variedad de poblaciones y realizar PCA para revelar la ubicación y población de origen de la persona.

Resultados

Después de la restricción de la SNP conjunto de SNPedia a aquellos con alelos pintadas verdes, es decir, "bueno", hay 4.967 SNPs con la que construir el "hombre perfecto" ( disponible para su descarga aquí ).

Un conjunto de datos de individuos con genotipo se puede obtener a partir de 1.000 genomas entre ellos los africanos, (indígenas) americanos, los asiáticos orientales y europeos.

La trama PCA (componentes primero y segundo) que muestra todos los individuos, junto con el "hombre perfecto" (en rosa; véase la flecha) se muestra a continuación:

El vecino más cercano a lo "humano perfecto" es HG00737 , una mujer que es ... puertorriqueña . Uno podría imaginar que una persona así ya existía, quizá Yuiza, la única mujer Taino Cacique (jefe) de la historia de Puerto Rico:

De Samuel Lind 'Yuiza'

Pero a medida que los programas de tercero de...
componentes principales, cosificar el "hombre perfecto" es una empresa engañosa:

Aquí el "hombre perfecto" se revela que decididamente no humano. Esto no es sorprendente, ya que refleja el hecho de que los alelos de la "perfecta humana" lugar es atípico como significativo para la población humana. De hecho, esto es aún más evidente en el caso de la "peor humana", es decir, la persona que tiene los alelos "malos" en cada SNP. Una proyección de esa persona en cualquier combinación de componentes principales muestra que se saquen lejos de cualquier ser humano real. La mejor visualización aparece en la proyección sobre la segunda y tercera componentes principales, donde aparecen como un valor atípico clara (punto DYS de etiqueta), y diametralmente opuesta a los africanos:

El hecho de que el "peor humana" no se proyecta bien en cualquiera de los componentes principales, mientras que la "humana perfecta" no es difícil de entender desde los principios básicos de genética de poblaciones. Es un ejercicio interesante que dejo al lector.

Conclusión

El hecho de que el "hombre perfecto" es puertorriqueño tiene mucho sentido.Desde muchos SNPs enfermedad son específicos de la población , tiene sentido que un individuo homocigoto para todos los "buenos" alelos debe mezclarse. Y eso es exactamente lo que los puertorriqueños son. En un " mujeres en la diáspora"estudio, las mujeres puertorriqueñas nacido en la isla pero que viven en los Estados Unidos, se mostró a ser 53,3 ± 2,8% Europea, 29,1 ± 2,3% de África Occidental, y el 17,6 ± 2,4% nativos. En otras palabras, para recoger todos los "buenos" alelos es necesario estar mezclados, pero mezcla en sí misma no es suficiente para la perfección. En lo personal, yo estaba feliz de ver la evidencia genética de la población apoyando mi admiración por el campeonato perenne Puerto Rico All Stars equipo:

En cuanto a Watson, parece apropiado que él debe donar las ganancias de su subasta en el genoma del Caribe de la Universidad de Puerto Rico .